Kara başlı kiraz kuşu 17 cm boyunda ve bataklık kiraz kuşuna göre daha uzun kuyruğa sahiptir. Dişilerinde baş kısmı gri renkte sırt kısmı gri ve kahve rengindedir. Erkelerin de ise adından anlaşılacağı gibi başı siyah renge kestane rengi üst kısımlara ve parlak sarı alt kısımlara sahiptir.
Dişilerin renkleri erkekler göre daha soluktur.
